La Serna del Monte está situada en un terreno relativamente llano, en la vertiente sur de la Sierra del Guadararama. Es un pequeñísimo término de forma alargada. El 90% de sus tierras son terrenos de pasto con matorral, castaños, rebollares, encinas, cardos y enebros. También hay pequeñas zonas de encinares claros sobre roca. El tercio norte es de monte bajo. Está bañado por el arroyo de las Cárcavas que nace a un kilómetro del núcleo y lo bordea por su lado oeste.

El pueblo está situado en la margen izquierda de la carretera A-1 y en una zona que históricamente ha sido paso obligado de los principales ejes de comunicación entre las mesetas norte y sur. Se encuentra incluido en el área de influencia del puerto de Somosierra.